@tue 英語苦手ですが、prusaprintとoctoprintの違いは、初期プリンタプロファイルにprusaが入っている、あとシリアルポートの設定ぐらいまで入ってるのかな？ぐらいの差ではないかと思います。
https://community.octoprint.org/t/will-prusaprint-work-with-an-external-raspberry-pi-on-a-prusa-i3-mk3/4591

ソースコード見ても最適化などはなさそうに見えます。SSHで入れないようにとかもあるみたいな。
いろいろいい加減な読み方なのであれですが。
prusa3d/OctoPi: Scripts to build OctoPi, a Raspberry PI distro for controlling 3D printers over the web https://github.com/prusa3d/OctoPi