SHIELD TV Remoteが第1世代(USB給電式)なのか、第2世代(ボタン電池交換式)なのかによりますけど、もし第2世代であるのならば接触不良が考えられます。

ボタン電池挿入部の接点端子をボタン電池へしっかりと触れるようにちょっと曲げるだけで直すことが可能です。