@ncrt035 こう言うと大変な申し訳なさを感じてしまうんですが「昔のやり方」もしくは「低スペックPCユーザのやり方」です
前者はPhotoshopだろうとコミスタだろうと不安定だった時代があったので、ソフト自体に掛かる負荷を軽減するために用いていた手法
後者は昨今だと高解像度なデータ納品を求められるのでレイヤーを重ねすぎるとPCの処理が追いつかないので統合して軽くするという手法
現在は広告などを中心に立ち絵をアニメーションさせるという需要からPSDを各パーツでレイヤー分けして納品するという案件がありますので、PSDのレイヤーを全て統合しちゃいけないこともあるんですね
こういう案件が存在するので片っ端から統合していくと後から涙目になることは想定できます