色々実験していたんですけど、やっぱりMOVコンテナはMP4コンテナと比較してデコード速度が遅い
ノンリニア編集のタイムラインの表示速度やスクロール速度にも影響するようで、リアルタイムでフィルタあてたプレビューにも当然影響する
実験では同品質のH.264+AACを格納したMOVとMP4で確認したところ体感して判るレベルでMOVは遅い
ということで、これを解決するにはやっぱりffmpegです
ffmpeg -i INPORT.mov -vcodec copy -acodec copy EXPORT.mp4
-vcodecと-acodecは格納された映像・音声ソースのことでコレをまるっと可能な限りコピーしコンテナのみ変更する
コンテナのみ変更されるので処理速度は数秒で終了され、普段の編集でもそう苦にはならないはず
カメラの撮影フォーマットがMOVなら編集前のおまじないとしてMP4にしておくと幸せになれるはずです