自宅のDNS設定をマルウェア対策として、cloudflareのセキュリティ対策用(1.1.1.2)にしていたのですが、
nintendoとかのアクセスが遅い理由が物理的にかなり遠いサーバを返してきていることが判明。

とりあえず、標準のDNSに戻すことに。Adguard DNSとかの方がよさそう。