22世紀、人類は量子論を理論的に確実な物とし、世界は量子を中心として回るようになった。
ある日、普通の量子サラリーマンである山田は量子鉄道に乗って量子通勤をしていた。量子通勤路の途中で一人の少女が突然量子もつれを起こし量子テレポーテーションをしてしまう。この事態に量子警察が出動し、山田は量子乱用罪として量子監獄へ投獄されてしまう。その騒ぎを聞きつけた反量子論組織が動き出し、山田の量子脱獄をする手助けをはじめる。