自分もドリキンさんのSSDマウントの組み木みたいな合体モノ作ろうとしてるんですけど、こういうやつをプリントしてパーツ同士の嵌り具合を確認したらどうでしょうか。
Tolerance TestとかClearance Testでいろいろ出てきます。
https://www.thingiverse.com/thing:2006297