ネジ穴が緩くなって締められなくなってしまった件は、タップを立て直すことで解決。
M4をM5に拡張しました。
ホームセンターで購入したネジが付いてます。
(重なるパーツは、もともとM5ネジがすっぽり入る径だったので、加工不要でした。X軸のアルミフレームの穴2箇所だけ修正しました。)

X軸がガタついてしまい、水平が取れなかった件も各所のネジをちゃんと締めてあげることで、自然と解決。
(プレートがガタつかない程度で。締めすぎ注意ですw)

※昨日、ボソッと考えた、金属用のパテを使うアイディアは、ホームセンターの店員さんに相談した結果、NGとのことでしたw
ネジ穴を復活させる用途では使えないし、接着してしまうと取れなくなる。。正論ですw