ApplePayはIDとQUICPay
FeliCaのエクストリームカード枠にsuica

Edyは未対応だったように記憶してます。
IDとQUICPayはダブルクリックが面倒なので少額決済は全部suicaで良いと思います。
手動チャージが若干面倒ですが、そこは毎回ダブルクリックと比較してコストが少ないsuicaがオススメです。