いまでも、サードパーティ製のアプリを使えばFLACやHiRes音源も聴けますよね。
ただ、管理を一元化したいという願望ですね。iPod時代から、Appleは音質や音源には何処か見限りをつけているというか、いま一歩届いていない印象です。
いまだからこそ、すげーパワーアップしたiPod classicとかも良いなぁとも思います。