エンコードした動画のクオリティが（動きのあるシーンや細かい模様が動くシーンで）波打つように悪化する現象についてAdobe MAX Japanで質問しました
プリセットのVBR（可変ビットレート）が原因ではないかとのことでした
昔ほど動画の容量にシビアになる必要は無いのでMBR（固定ビットレート）でエンコードした方が良いらしいです
質問の後で作った動画でMBRにしてみましたが動きが少なかったのでまた次の動画で試してみます