以前Apple WatchにSuicaが追加できなくなってサポートと1週間掛けてやり取りしたのですが、最終的に解決したソリューションは下記でした。
①iPhoneで新規の適当なappleアカウント作ってログイン
②apple watchをペアリング
③apple watchに存在しないクレジットカードを登録
※登録時にエラーになって良い
④iPhoneで普段使っているappleアカウントでログイン
⑤apple watchを再度ペアリング

どうやらsuicaが登録できなくなるのはサーバー側に中途半端な状態で端末とsuicaの紐付け情報が残ってしまうからのようです。
※ネットが不安定な状態でsuica登録したりとかすると発生

そしてサーバー側で端末の紐付け情報がリセットされるのは、別のappleアカウントでクレジットカードを登録するイベントが発生した時との事でした。
登録イベントを起こすだけで良いので、クレカ番号は適当で良いと。